22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3601 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  100 
 
 		 250 aa  507  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  64.96 
 
 		 247 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  64.31 
 
 		 248 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  61.2 
 
 		 244 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  61.2 
 
 		 267 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  63.2 
 
 		 256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  62.4 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  55.43 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  56.32 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  54.65 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  40.08 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  27.88 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  27.88 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  30.74 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  26.84 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  28.27 
 
 		 282 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1809  hypothetical protein  24.72 
 
 		 278 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.421522  hitchhiker  0.00000000151878 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  26.91 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  24.11 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  23.53 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  23.72 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1356  hypothetical protein  22.46 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>