22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2854 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  524  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  41.84 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  33.71 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  30.47 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  28.83 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  30.34 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  29.07 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  29.07 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  30.52 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  28.4 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  26.45 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  26.45 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  31.12 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  27.39 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  27.67 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  32.58 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  27.87 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  23.4 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1356  hypothetical protein  27.6 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  22.93 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0036  hypothetical protein  25.22 
 
 		 306 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  28.24 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>