23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3070 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  549  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  42.86 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  32.64 
 
 
287 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  29.73 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  29.73 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  32.92 
 
 
273 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  29.46 
 
 
256 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  31.66 
 
 
273 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  31.47 
 
 
278 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  32.17 
 
 
293 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  29.07 
 
 
244 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  33.2 
 
 
269 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  29.07 
 
 
267 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  30.16 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  28.73 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  27.24 
 
 
248 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  27.89 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  22.46 
 
 
254 aa  62.4  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  22.1 
 
 
254 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1809  hypothetical protein  25.32 
 
 
278 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.421522  hitchhiker  0.00000000151878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0036  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1356  hypothetical protein  25.1 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  26.62 
 
 
264 aa  52.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>