18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1809 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1809  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.421522  hitchhiker  0.00000000151878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  38.11 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  25.88 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  23.87 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  25.4 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  25 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  24.16 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  24.16 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  25.46 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  25.94 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  26.86 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  24.18 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  23.27 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  21.32 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  22.62 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  25.54 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  21.6 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  21.6 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>