35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0983 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  100 
 
 
264 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  100 
 
 
264 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  31.58 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  28.95 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  28.95 
 
 
244 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  29.92 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  28.95 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  29.5 
 
 
282 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  28.52 
 
 
273 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  27.94 
 
 
273 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  27.04 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  26.67 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  23.72 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  26.42 
 
 
250 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  26.36 
 
 
293 aa  85.5  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  26.69 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  27.83 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0036  hypothetical protein  24.53 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3497  hypothetical protein  27.45 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  23.81 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003452  putative maturation protein  23.39 
 
 
353 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.171199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1356  hypothetical protein  20.83 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  30.08 
 
 
750 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3269  phage-related secreted protein  27.15 
 
 
460 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  23.16 
 
 
254 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  22.59 
 
 
254 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  24.3 
 
 
1421 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3908  Type II secretory pathway, component PulD  25.86 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297112  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  28.75 
 
 
650 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1809  hypothetical protein  21.6 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.421522  hitchhiker  0.00000000151878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  30.17 
 
 
686 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  30.17 
 
 
686 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  30.17 
 
 
686 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  30.17 
 
 
686 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  30.17 
 
 
686 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>