21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3363 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  100 
 
 		 248 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  87.1 
 
 		 247 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  66.95 
 
 		 250 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  60 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  60 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  61.32 
 
 		 256 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  61.43 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  52.03 
 
 		 273 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  52.9 
 
 		 273 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  52.19 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  40.6 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  26.43 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  27.87 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  27.34 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  27.83 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  27.83 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1809  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.421522  hitchhiker  0.00000000151878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  23.86 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  25.74 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  25.74 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  22.76 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>