More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2715 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2715  ABC transporter related protein  100 
 
 
263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148144  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  43.13 
 
 
565 aa  222  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0368  ABC peptide transporter, ATPase subunit  46.74 
 
 
280 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.834781  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.08 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188886  normal  0.0439105 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.97 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.64 
 
 
564 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.46 
 
 
661 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1093  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 
356 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4477  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 
326 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.178074  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0938  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 
332 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3079  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.53 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41088  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 
328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.97058  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1094  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45 
 
 
332 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7027  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.97 
 
 
322 aa  215  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.3 
 
 
703 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 
359 aa  214  9e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.15 
 
 
671 aa  214  9e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2854  putative oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.38 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.609157  normal  0.248149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3292  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.68 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0313  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.79 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  43.08 
 
 
557 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
325 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2573  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 
333 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2264  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  42.41 
 
 
333 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0690  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
338 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0222282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1243  ABC transporter related  44.19 
 
 
575 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  41.98 
 
 
561 aa  211  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1812  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.05 
 
 
328 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.15 
 
 
548 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.36 
 
 
331 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1298  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 
327 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0477  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.25 
 
 
341 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000893655  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2923  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.06 
 
 
328 aa  210  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0982  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.02 
 
 
334 aa  209  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  44.4 
 
 
550 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1325  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 
351 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1572  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 
351 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.413951  normal  0.0220603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.75 
 
 
708 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  43.19 
 
 
566 aa  209  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3106  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
330 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.236383  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  41.22 
 
 
572 aa  208  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  43.63 
 
 
542 aa  208  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 
571 aa  208  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4326  ABC transporter related  43.4 
 
 
548 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0444322  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2643  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 
327 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.791522  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0236  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.02 
 
 
332 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  42.64 
 
 
573 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  44.73 
 
 
550 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.69 
 
 
320 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000196447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  43.41 
 
 
542 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  43.41 
 
 
542 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D21  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  40.77 
 
 
338 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2030  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  39.69 
 
 
338 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0575339  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1635  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.64 
 
 
315 aa  207  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.861847  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2837  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
335 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  42.41 
 
 
571 aa  206  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1243  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  41.63 
 
 
320 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.38 
 
 
332 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4612  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.02 
 
 
331 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.253651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0401  ABC transporter related  43.85 
 
 
311 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0187  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.24 
 
 
327 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235094  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.7 
 
 
643 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0046  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.07 
 
 
336 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0185  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 
334 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  43.41 
 
 
542 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.3 
 
 
351 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551988  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1358  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.08 
 
 
322 aa  205  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.303636  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  42.41 
 
 
571 aa  205  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4266  ABC transporter related  42.98 
 
 
548 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5112  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 
336 aa  205  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4157  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.92 
 
 
338 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.55271 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1049  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.55 
 
 
330 aa  204  8e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.933184  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3795  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 
329 aa  204  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.31 
 
 
353 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00642  ABC transporter ATPase component  37.84 
 
 
285 aa  204  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2948  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 
341 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247971  normal  0.0180943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.64 
 
 
342 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.467741  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5671  ABC transporter related  43.19 
 
 
271 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0212  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 
336 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  41.09 
 
 
571 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 
334 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  46.47 
 
 
557 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3883  ABC di/oligopeptide transporter, ATPase subunit  42.25 
 
 
338 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.86 
 
 
322 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.173398 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  41.31 
 
 
553 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0207  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
336 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0440  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
330 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5012  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 
338 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0612  oligopeptide transporter ATP-binding component  40.77 
 
 
324 aa  203  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0223  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 
330 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001851  oligopeptide transport ATP-binding protein OppD  37.84 
 
 
285 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  43.46 
 
 
541 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 
338 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2723  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.25 
 
 
324 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  0.451475 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0259  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein DppD  43.08 
 
 
330 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2439  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.92 
 
 
320 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.55 
 
 
353 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0246  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein DppD  43.08 
 
 
330 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  45.8 
 
 
585 aa  202  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  41.63 
 
 
531 aa  202  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>