40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1569 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  743    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  41.67 
 
 
377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  41.67 
 
 
369 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  39.47 
 
 
369 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  40.36 
 
 
366 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  40.35 
 
 
352 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  36.39 
 
 
343 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  33.82 
 
 
407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  32.26 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  32.42 
 
 
373 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  30.3 
 
 
328 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  32.46 
 
 
336 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  33.81 
 
 
282 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  27.96 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5799  hypothetical protein  28.89 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000239869 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5629  hypothetical protein  28.89 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.101304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  33.52 
 
 
690 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  28.37 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  27.14 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16710  hypothetical protein  29.97 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0642615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  28.37 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  28.37 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4750  hypothetical protein  29.25 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  27.46 
 
 
352 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  31.52 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  32.5 
 
 
255 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  32.33 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  26.45 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  28.18 
 
 
323 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  22.19 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1616  hypothetical protein  29.38 
 
 
419 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00112632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  30.6 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  23.21 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  26.36 
 
 
380 aa  50.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  28.48 
 
 
429 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  34.38 
 
 
362 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1993  hypothetical protein  27.27 
 
 
389 aa  46.2  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5515  hypothetical protein  27.49 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000112795  hitchhiker  0.00000000892975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1429  hypothetical protein  25.7 
 
 
422 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.385968  normal  0.609586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1829  hypothetical protein  30.18 
 
 
353 aa  43.1  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>