33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1461 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  634    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  45.68 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  32.51 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  33.63 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  33.14 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  32.82 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  38.11 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  33.94 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5629  hypothetical protein  35.65 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.101304 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5799  hypothetical protein  35.65 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000239869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  33.64 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  33.64 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  33.13 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  35.24 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  32.77 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  30.38 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  29.79 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  54.72 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  23.99 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  28.31 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  24.3 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 366 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  30.03 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  36.22 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1829  hypothetical protein  31.7 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4750  hypothetical protein  26.32 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  31.98 
 
 		 690 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  42.47 
 
 		 255 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  33.48 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  33 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1616  hypothetical protein  40 
 
 		 419 aa  46.2  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00112632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  40.48 
 
 		 429 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13290  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00147583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>