37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2441 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  672    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  56.34 
 
 
369 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  40.35 
 
 
375 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  40.87 
 
 
369 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  39.76 
 
 
377 aa  176  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  41.34 
 
 
366 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  37.5 
 
 
343 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  39.58 
 
 
407 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  34.38 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  35.16 
 
 
357 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  32.52 
 
 
373 aa  93.2  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  34.15 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  35.24 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  32.13 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  29.83 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  29.34 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  28.45 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  29.18 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  29.18 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  30.91 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  27.27 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  28.42 
 
 
384 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  24.4 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  29.52 
 
 
255 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16710  hypothetical protein  26.96 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0642615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  34.91 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5629  hypothetical protein  37.27 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.101304 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5799  hypothetical protein  37.27 
 
 
321 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000239869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  27.08 
 
 
690 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  25.93 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  27.73 
 
 
323 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4750  hypothetical protein  27.16 
 
 
353 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1429  hypothetical protein  36.36 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.385968  normal  0.609586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  31.82 
 
 
429 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3380  hypothetical protein  30.41 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  26.78 
 
 
380 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  40.91 
 
 
362 aa  43.9  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>