17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7400 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  100 
 
 
690 aa  1335    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  28.94 
 
 
343 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  32.96 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  34.04 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  31.84 
 
 
328 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  28.65 
 
 
377 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  30.65 
 
 
366 aa  61.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  29.73 
 
 
407 aa  57.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  29.38 
 
 
369 aa  55.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  29.95 
 
 
373 aa  54.7  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  27.08 
 
 
352 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  30.77 
 
 
357 aa  50.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  29.41 
 
 
336 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  33.61 
 
 
313 aa  45.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1616  hypothetical protein  26.14 
 
 
419 aa  44.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00112632  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  26.95 
 
 
337 aa  44.3  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  34.21 
 
 
349 aa  43.9  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>