35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3588 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  666    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  32.26 
 
 		 375 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  38.64 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  35.73 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  35.16 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  36.94 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  32.61 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  36.36 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  30.9 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  29.34 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  30.81 
 
 		 349 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  29.11 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  33.43 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  29.73 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  30.29 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  31.43 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  30.29 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  30.29 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  33.16 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  28.91 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  23.64 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  37.19 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5799  hypothetical protein  34.91 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000239869 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5629  hypothetical protein  34.91 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.101304 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  44.79 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16710  hypothetical protein  29.92 
 
 		 371 aa  57  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0642615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  35.58 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  23.55 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4750  hypothetical protein  38.35 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  28.7 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  29.12 
 
 		 690 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  42.86 
 
 		 282 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  29.61 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  35.16 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  56.41 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>