27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0302 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  687    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  43.48 
 
 
328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  36.39 
 
 
375 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  35 
 
 
377 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  35.82 
 
 
369 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  37.5 
 
 
352 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  35.41 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  34.93 
 
 
366 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  32.1 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  29.34 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  31.27 
 
 
373 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  28.21 
 
 
690 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  23.21 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  25.08 
 
 
352 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  23.81 
 
 
337 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1616  hypothetical protein  28.16 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00112632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  26.75 
 
 
352 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  24.46 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  26.77 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  27.47 
 
 
429 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  24.16 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  24.16 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16710  hypothetical protein  24.86 
 
 
371 aa  50.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0642615 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  30.94 
 
 
382 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  28.73 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  25.08 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3380  hypothetical protein  24.93 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>