28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2449 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  74.71 
 
 
352 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  59.03 
 
 
348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  59.03 
 
 
348 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  59.03 
 
 
348 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  58.69 
 
 
352 aa  340  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5799  hypothetical protein  45.16 
 
 
321 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000239869 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5629  hypothetical protein  45.16 
 
 
321 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.101304 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  42.54 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1829  hypothetical protein  39.33 
 
 
353 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  36.81 
 
 
362 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  33.64 
 
 
373 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  32.56 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  31.48 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  27.14 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  28.74 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  28.45 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  31.02 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  26.75 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  27.41 
 
 
384 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  25.47 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  26.82 
 
 
407 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4750  hypothetical protein  25.91 
 
 
353 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  30.09 
 
 
255 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  27.07 
 
 
369 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  32.2 
 
 
369 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  27.44 
 
 
366 aa  43.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  25.87 
 
 
328 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>