28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3427 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  789    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  39.63 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  38.99 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  34.01 
 
 		 375 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  39.34 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  36.23 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  32.35 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  33.13 
 
 		 369 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  29.45 
 
 		 328 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  33.43 
 
 		 357 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  29.94 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  30.23 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  37.21 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  40 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  41.94 
 
 		 255 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  35.65 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  28.16 
 
 		 690 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  38.54 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5629  hypothetical protein  35.92 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.101304 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5799  hypothetical protein  35.92 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000239869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  38 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  38 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  22.89 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  30.97 
 
 		 282 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  24.78 
 
 		 337 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  34.65 
 
 		 323 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  29.74 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  30.48 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>