28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5399 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  659    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  43.48 
 
 
343 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  34.38 
 
 
352 aa  129  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  30.46 
 
 
369 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  31.41 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  31.53 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  30.3 
 
 
375 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  30.9 
 
 
357 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  29.19 
 
 
407 aa  93.2  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  31.61 
 
 
373 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  26.61 
 
 
366 aa  79  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  27.19 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  27.57 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  27.57 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  31.84 
 
 
690 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  31.98 
 
 
429 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  27.89 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3380  hypothetical protein  26.1 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  27.89 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  43.94 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1616  hypothetical protein  27.18 
 
 
419 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00112632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  39.44 
 
 
336 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  29.01 
 
 
384 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1429  hypothetical protein  35.63 
 
 
422 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.385968  normal  0.609586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  31.65 
 
 
384 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  31.63 
 
 
349 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13290  hypothetical protein  31.18 
 
 
352 aa  43.5  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00147583  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  35.64 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>