19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15860 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  729    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  42.89 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1993  hypothetical protein  35.59 
 
 		 389 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  36.27 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1429  hypothetical protein  31.88 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.385968  normal  0.609586 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  28.43 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  26.23 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  38.89 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1616  hypothetical protein  26.96 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00112632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  31.52 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  28.95 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  30.54 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3380  hypothetical protein  26.46 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16710  hypothetical protein  27.57 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0642615 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  29.17 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  31.65 
 
 		 328 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  46.67 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  41.89 
 
 		 373 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>