32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  731    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  45.68 
 
 		 336 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  34.58 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  32.14 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  32.54 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  34.44 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  32.09 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  31.87 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  33.03 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  31.81 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  30.46 
 
 		 323 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  31.58 
 
 		 348 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  31.58 
 
 		 348 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  31.55 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  33.04 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5799  hypothetical protein  30.58 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000239869 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5629  hypothetical protein  30.58 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.101304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  29.97 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  24.56 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  31.04 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  29.97 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  29.63 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  25.96 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  30.47 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  29.32 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  29.84 
 
 		 690 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  41.9 
 
 		 282 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5515  hypothetical protein  24.92 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000112795  hitchhiker  0.00000000892975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  39.51 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  31.37 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  47.06 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  36.78 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>