22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1912 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  711    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  41.27 
 
 
382 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  37.82 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1993  hypothetical protein  34.05 
 
 
389 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1429  hypothetical protein  27.83 
 
 
422 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.385968  normal  0.609586 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  23.48 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  23.96 
 
 
337 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  32.35 
 
 
429 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1616  hypothetical protein  27.25 
 
 
419 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00112632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  27.25 
 
 
375 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  29.07 
 
 
366 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  29.4 
 
 
373 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  30.1 
 
 
377 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  35.79 
 
 
357 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  28.57 
 
 
369 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  44.44 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  42.19 
 
 
348 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  42.19 
 
 
348 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  42.19 
 
 
348 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  26.28 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0296  hypothetical protein  24.47 
 
 
220 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0264992  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0691  hypothetical protein  25.9 
 
 
288 aa  43.1  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>