22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4494 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  699    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  85.16 
 
 
337 aa  596  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1616  hypothetical protein  33.25 
 
 
419 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00112632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  40.45 
 
 
429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  28.43 
 
 
384 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  22.62 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  25.75 
 
 
373 aa  63.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1993  hypothetical protein  27.7 
 
 
389 aa  61.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  26.57 
 
 
357 aa  60.1  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3380  hypothetical protein  25.88 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  27.89 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  22.01 
 
 
380 aa  56.6  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  22.19 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  26.88 
 
 
382 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  26.43 
 
 
377 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13290  hypothetical protein  25.36 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00147583  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  28.1 
 
 
336 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  25.93 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  28.26 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  22.89 
 
 
407 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1429  hypothetical protein  39.58 
 
 
422 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.385968  normal  0.609586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  26.95 
 
 
690 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>