35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4534 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  715    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  74.44 
 
 		 369 aa  424  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  42.24 
 
 		 375 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  39.82 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  36.39 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  35 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  38.44 
 
 		 366 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  38.92 
 
 		 357 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  36.93 
 
 		 407 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  31.12 
 
 		 328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  34.09 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  36.11 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  37.37 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  37.12 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  29.55 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  29.68 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1993  hypothetical protein  38.07 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  39.47 
 
 		 255 aa  67  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  28.73 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  35.67 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  29.97 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  28.79 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  28.79 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  28.65 
 
 		 690 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  28.53 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  30.79 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  34.1 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  23.55 
 
 		 337 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  38.74 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  25.15 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  29.86 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4750  hypothetical protein  26.14 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1429  hypothetical protein  53.49 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.385968  normal  0.609586 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3380  hypothetical protein  27.88 
 
 		 359 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16710  hypothetical protein  25.33 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0642615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>