19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1993 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1993  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  744    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  39.39 
 
 
384 aa  179  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  38.83 
 
 
382 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  35.43 
 
 
380 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  37.99 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  28.5 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1429  hypothetical protein  26.21 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.385968  normal  0.609586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1616  hypothetical protein  24.82 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00112632  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  29.05 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  27.89 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  30.41 
 
 
366 aa  57  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  30.77 
 
 
429 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  31.87 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  28.69 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  32.58 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  28.12 
 
 
352 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  28.34 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  24.73 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3380  hypothetical protein  26.83 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>