16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1616 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1616  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  827    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00112632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  48.42 
 
 
429 aa  333  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  32.34 
 
 
337 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  33.25 
 
 
337 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  30.43 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13290  hypothetical protein  27.07 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00147583  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  26.85 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  28.16 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  26.57 
 
 
380 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  29.94 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  28.64 
 
 
328 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  26.14 
 
 
690 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3380  hypothetical protein  26.14 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  29.41 
 
 
369 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  40 
 
 
336 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  41.67 
 
 
384 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>