23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2141 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  743    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  28.61 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  32.13 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  29.12 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  28.84 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  28.82 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  28.82 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  28.41 
 
 
369 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  29.53 
 
 
352 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  28.86 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  31.16 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  33.9 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  28.03 
 
 
373 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  28.37 
 
 
352 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16710  hypothetical protein  27.3 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0642615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  29.01 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  25.36 
 
 
323 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  25.87 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  50 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  47.37 
 
 
362 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  27.92 
 
 
429 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  46.67 
 
 
384 aa  43.9  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1616  hypothetical protein  41.67 
 
 
419 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00112632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>