28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3950 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  686    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  74.71 
 
 
349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  58.36 
 
 
348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  58.36 
 
 
348 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  58.36 
 
 
348 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  61.74 
 
 
352 aa  347  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5629  hypothetical protein  48.06 
 
 
321 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.101304 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5799  hypothetical protein  48.06 
 
 
321 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000239869 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  43.31 
 
 
323 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1829  hypothetical protein  37.72 
 
 
353 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  33.61 
 
 
362 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  33.94 
 
 
373 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  31.63 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  29.74 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  29.15 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  29.46 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  27.33 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  30.95 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  26.45 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  25.92 
 
 
407 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  31.62 
 
 
255 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  29.56 
 
 
282 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  29.24 
 
 
384 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4750  hypothetical protein  27.1 
 
 
353 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  27.3 
 
 
328 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  27.5 
 
 
366 aa  46.2  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5515  hypothetical protein  27.14 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000112795  hitchhiker  0.00000000892975 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  23.62 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>