30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12726 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  689    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  62.68 
 
 
348 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  62.39 
 
 
348 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  62.39 
 
 
348 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  61.74 
 
 
352 aa  368  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  58.69 
 
 
349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5629  hypothetical protein  46.96 
 
 
321 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.101304 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5799  hypothetical protein  46.96 
 
 
321 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000239869 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  44.79 
 
 
323 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  32.72 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1829  hypothetical protein  34.35 
 
 
353 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  31.43 
 
 
362 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  32.11 
 
 
336 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  30.79 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  29.89 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  27.54 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  32.57 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  30.68 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  25.53 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  28.94 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  28.02 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  34.29 
 
 
255 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  32.38 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  28.18 
 
 
380 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4750  hypothetical protein  26.11 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5515  hypothetical protein  27.6 
 
 
316 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000112795  hitchhiker  0.00000000892975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  28.74 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  24.05 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  22.58 
 
 
337 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  29.61 
 
 
282 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>