18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2234 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  715    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  35.46 
 
 
349 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  33.61 
 
 
352 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  31.88 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  31.88 
 
 
348 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  31.88 
 
 
348 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1829  hypothetical protein  32.85 
 
 
353 aa  87  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  35.24 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  29.62 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5799  hypothetical protein  41.76 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000239869 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5629  hypothetical protein  41.76 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.101304 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  35.38 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  29.79 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  44.79 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  38.74 
 
 
377 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  34.38 
 
 
375 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  36.94 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  47.37 
 
 
384 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>