28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1829 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1829  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  664    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  39.5 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  35.56 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  35 
 
 		 348 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  35 
 
 		 348 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  37.72 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  33.24 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  33.14 
 
 		 362 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5799  hypothetical protein  31.66 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000239869 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5629  hypothetical protein  31.66 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.101304 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  31.25 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  30.18 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  30.45 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  31.48 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  33.45 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  33.14 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  31.52 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4750  hypothetical protein  29.34 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  27.78 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  41.49 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  28.68 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  29.97 
 
 		 377 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  29.01 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  31.68 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  49.02 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  25.08 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  27.93 
 
 		 384 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>