33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5044 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  706    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  76.4 
 
 
377 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  41.21 
 
 
375 aa  229  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  40.87 
 
 
352 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  35.96 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  35.82 
 
 
343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  40.17 
 
 
366 aa  173  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  34.58 
 
 
407 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  36.9 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  31.53 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  31.62 
 
 
373 aa  77  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  34.78 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  26.32 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  28.45 
 
 
337 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  54.72 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  28.75 
 
 
690 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2141  hypothetical protein  35.23 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0129006  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  34.95 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  34.23 
 
 
429 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  30.95 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  35.92 
 
 
255 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  33.5 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1993  hypothetical protein  32.22 
 
 
389 aa  50.8  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  31.43 
 
 
382 aa  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  27.51 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  27.51 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  29.3 
 
 
352 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  27.58 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  34.58 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2234  hypothetical protein  38.46 
 
 
362 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0995506  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4750  hypothetical protein  24.93 
 
 
353 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1429  hypothetical protein  53.33 
 
 
422 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.385968  normal  0.609586 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16710  hypothetical protein  26.15 
 
 
371 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0642615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>