24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2971 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  550  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  32.23 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  34 
 
 		 375 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  32.59 
 
 		 255 aa  95.5  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  34.15 
 
 		 352 aa  89  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  35.18 
 
 		 377 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2175  hypothetical protein  33.65 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2221  hypothetical protein  33.65 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458468  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  33.65 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  34.52 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4750  hypothetical protein  32.51 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2449  hypothetical protein  28.46 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  27.99 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  41.9 
 
 		 373 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  30.77 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5799  hypothetical protein  30.8 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000239869 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5629  hypothetical protein  30.8 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.101304 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  32.05 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  30.97 
 
 		 407 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  28.73 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12726  hypothetical protein  29.61 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  42.86 
 
 		 357 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1829  hypothetical protein  32.34 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  42.06 
 
 		 690 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>