25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2217 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  727    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1569  hypothetical protein  40.36 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00467674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3427  hypothetical protein  38.99 
 
 
407 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.575552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5044  hypothetical protein  40.34 
 
 
369 aa  169  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0151406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  38.44 
 
 
377 aa  163  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  36.31 
 
 
369 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  41.34 
 
 
352 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  34.93 
 
 
343 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3588  hypothetical protein  29.73 
 
 
357 aa  90.1  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27530  hypothetical protein  30.14 
 
 
373 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  26.61 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2971  hypothetical protein  32.05 
 
 
282 aa  64.7  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2266  hypothetical protein  37.08 
 
 
313 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16710  hypothetical protein  27.35 
 
 
371 aa  60.1  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0642615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7400  hypothetical protein  30.17 
 
 
690 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.184015  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4791  hypothetical protein  36.78 
 
 
255 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3380  hypothetical protein  25.77 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3950  hypothetical protein  26.59 
 
 
352 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5279  hypothetical protein  31.55 
 
 
323 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000309085  normal  0.00944563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  29.88 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1461  hypothetical protein  28.27 
 
 
336 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1993  hypothetical protein  30.3 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  28.05 
 
 
382 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1912  hypothetical protein  28.24 
 
 
380 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2164  hypothetical protein  25.81 
 
 
348 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659874  hitchhiker  0.00212819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>