15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3380 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013531  Xcel_3380  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  709    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4331  hypothetical protein  26.05 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1610  hypothetical protein  30.23 
 
 
429 aa  63.2  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000381976 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4494  hypothetical protein  24.93 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15860  hypothetical protein  27.42 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.175693  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5399  hypothetical protein  26.98 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.278266 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2059  hypothetical protein  30.72 
 
 
382 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048164  normal  0.79558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2441  hypothetical protein  27.7 
 
 
352 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0366184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0302  hypothetical protein  28.99 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2217  hypothetical protein  28.29 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1616  hypothetical protein  26.14 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00112632  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16710  hypothetical protein  27.25 
 
 
371 aa  44.3  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0642615 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1429  hypothetical protein  29.87 
 
 
422 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.385968  normal  0.609586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4534  hypothetical protein  27.88 
 
 
377 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7195  hypothetical protein  29.14 
 
 
369 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0322686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>