87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1632 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1632  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  329  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0596181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04260  rod shape-determining protein MreD  30.77 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0975  rod shape-determining protein MreD  28.29 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0935  rod shape-determining protein MreD  28.29 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0942  rod shape-determining protein MreD  28.95 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4280  rod shape-determining protein MreD  27.63 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0328  rod shape-determining protein MreD  21.29 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0530008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0513  rod shape-determining protein  27.97 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0134717  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1646  rod shape-determining protein MreD  27.97 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000897868  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0670  rod shape-determining protein  28.46 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0272534  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0589  rod shape-determining protein MreD  28.46 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.305731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2726  rod shape-determining protein MreD  30.16 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0795555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3452  rod shape-determining protein MreD  26.71 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.973834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0560  rod shape-determining protein MreD  20.18 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227811  normal  0.273117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4400  rod shape-determining protein MreD  21.3 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.035191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0171  rod shape-determining protein MreD  23.08 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0840  rod shape-determining protein MreD  31.03 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4161  rod shape-determining protein MreD  27.63 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0405  rod shape-determining protein MreD  22.22 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4470  rod shape-determining protein MreD  27.63 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3820  rod shape-determining protein MreD  25.47 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0520  rod shape-determining protein MreD  25.47 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00293581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0858  rod shape-determining protein MreD  30.4 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.930455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0499  rod shape-determining protein MreD  25.47 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000751772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0524  rod shape-determining protein MreD  25.47 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.818556 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00266  rod shape-determining protein MreD  26.72 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.10714  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3685  rod shape-determining protein MreD  28.43 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00121025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0512  rod shape-determining protein MreD  27 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0185  rod shape-determining protein MreD  20.69 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4558  rod shape-determining protein MreD  24 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3736  rod shape-determining protein MreD  26.32 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.284622  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0481  rod shape-determining protein MreD  23.68 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12670  Rod shape-determining protein, MreD  27.14 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3470  rod shape-determining protein MreD  22.81 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168845  normal  0.899869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3646  rod shape-determining protein MreD  22.81 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.873858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0576  rod shape-determining protein MreD  23.36 
 
 		 162 aa  47.4  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136941  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4096  rod shape-determining protein MreD  23.58 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1196  rod shape-determining protein MreD  28.43 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00178529  hitchhiker  0.00199386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0400  rod shape-determining protein MreD  28.43 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.269342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4409  rod shape-determining protein MreD  27.45 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000516669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0467  rod shape-determining protein MreD  28.43 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00113622  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3332  rod shape-determining protein MreD  20.72 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.390226  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3921  rod shape-determining protein MreD  26.5 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58120  rod shape-determining protein MreD  25.17 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0469  rod shape-determining protein MreD  21.93 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.795079  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1007  rod shape-determining protein MreD  30.43 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3732  rod shape-determining protein MreD  26.47 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.391337  normal  0.0778624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0114  rod shape-determining protein MreD  27.03 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3635  rod shape-determining protein MreD  26.47 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148983  hitchhiker  0.00393044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3670  rod shape-determining protein MreD  26.47 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.501294  normal  0.526814 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3564  rod shape-determining protein MreD  26.47 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0238  rod shape-determining protein MreD  25.93 
 
 		 173 aa  44.3  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0144  rod shape-determining protein MreD  27.27 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.825294  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3563  rod shape-determining protein MreD  26.47 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.003884  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2836  rod shape-determining protein MreD  28 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00169793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3752  rod shape-determining protein MreD  18.42 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0156761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2238  rod shape-determining protein MreD  27.7 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1125  rod shape-determining protein MreD  29.73 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.424224  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1124  rod shape-determining protein MreD  28.57 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.974415  normal  0.147001 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0458  rod shape-determining protein MreD  27.27 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0128703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0265  rod shape-determining protein MreD  27.27 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0254  rod shape-determining protein MreD  27.27 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0028978  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03059  hypothetical protein  27.27 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00130668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0160  rod shape-determining protein MreD  26.52 
 
 		 170 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0078  rod shape-determining MreD transmembrane protein  27.13 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4565  rod shape-determining protein MreD  27.27 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00217188  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2787  rod shape-determining protein MreD  26.52 
 
 		 170 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2292  rod shape-determining protein MreD  26.52 
 
 		 170 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3731  rod shape-determining protein MreD  27.27 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000809472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5093  rod shape-determining protein MreD  27.43 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2372  rod shape-determining protein MreD  26.52 
 
 		 170 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341743  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03108  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreD  27.27 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00126641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3280  rod shape-determining protein MreD  27.27 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3544  rod shape-determining protein MreD  27.27 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0420872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0458  rod shape-determining protein MreD  27.27 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000615339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0168  rod shape-determining protein MreD  26.52 
 
 		 170 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0179  rod shape-determining protein MreD  26.52 
 
 		 170 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3438  rod shape-determining protein MreD  27.27 
 
 		 162 aa  42  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00180798  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0285  rod shape-determining protein MreD  24.62 
 
 		 173 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0364  rod shape-determining protein MreD  26.52 
 
 		 170 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6463  rod shape-determining protein MreD  25 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2498  rod shape-determining protein MreD  25.78 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3128  rod shape-determining protein MreD  25.78 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3112  rod shape-determining protein MreD  25.78 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.222418  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0081  putative rod shape-determining MreD transmembrane protein  25 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3675  rod shape-determining protein MreD  25.81 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0136907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1939  rod shape-determining protein MreD  24.22 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0021147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>