More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0359 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0359  OmpA/MotB  100 
 
 
241 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  33.78 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  31.08 
 
 
525 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  33.56 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  31.08 
 
 
525 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  32.88 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  32.88 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  32.19 
 
 
343 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.21 
 
 
263 aa  72  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  28.27 
 
 
299 aa  72  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  31.03 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  32.12 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  28.08 
 
 
463 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  34.56 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  33.33 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  32.88 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1997  OmpA/MotB domain protein  26.41 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  32.84 
 
 
291 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  32.43 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  32.59 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  27.4 
 
 
525 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  30.56 
 
 
375 aa  65.5  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 
337 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  32.31 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0835  OmpA/MotB domain protein  41.98 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.376588  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  29.17 
 
 
337 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  41.77 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  28.77 
 
 
799 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  30.14 
 
 
343 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  32.85 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  29.44 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  27.78 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  29.44 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  26.67 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  36.9 
 
 
321 aa  62.8  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  25.25 
 
 
246 aa  62.8  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  28.08 
 
 
342 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  32.8 
 
 
254 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  27.78 
 
 
337 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  35.14 
 
 
267 aa  62.4  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  31.62 
 
 
290 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  27.78 
 
 
648 aa  62  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  47.44 
 
 
280 aa  61.6  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  27.78 
 
 
337 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4077  OmpA/MotB domain protein  31.65 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  28.28 
 
 
341 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
314 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  29.81 
 
 
438 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  29.81 
 
 
438 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  29.66 
 
 
337 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2569  OmpA/MotB domain protein  26.32 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  32.64 
 
 
340 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  29.81 
 
 
438 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  29.81 
 
 
438 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  29.81 
 
 
438 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  27.96 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  29.81 
 
 
438 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  35 
 
 
575 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  29.56 
 
 
437 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 
427 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  33.33 
 
 
266 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  29.19 
 
 
438 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  27.78 
 
 
341 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  33.57 
 
 
440 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0360  OmpA/MotB  25.23 
 
 
230 aa  58.9  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.87469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4407  chemotaxis protein motB, C-terminus  31.79 
 
 
156 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  40.51 
 
 
262 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  31.79 
 
 
262 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  40.51 
 
 
262 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  37.89 
 
 
275 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  27.7 
 
 
784 aa  58.9  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 
362 aa  58.9  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  28.43 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 
271 aa  58.9  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  23.53 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  27.08 
 
 
341 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  31.79 
 
 
262 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
348 aa  58.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  43.04 
 
 
251 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  31.13 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  27.68 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1384  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.45 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  29.23 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  28.06 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  27.59 
 
 
342 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  30.71 
 
 
576 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2473  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.106364  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  35.8 
 
 
286 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  29.93 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  26.9 
 
 
343 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  38.37 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  27.22 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  31.78 
 
 
308 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0690  OmpA family protein  35.8 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.398507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  35.8 
 
 
179 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  29.03 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  25.79 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>