More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1091 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1091  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 387 aa  779    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.08586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1847  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.19 
 
 		 382 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232727  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2707  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  59.47 
 
 		 384 aa  451  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.371679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3372  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.84 
 
 		 384 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0267  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.84 
 
 		 384 aa  444  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.806293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1877  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.87 
 
 		 384 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0345  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.79 
 
 		 384 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3868  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.79 
 
 		 384 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4045  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.53 
 
 		 384 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3538  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.81 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3247  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  54.5 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1956  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  50.52 
 
 		 385 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.38 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5120  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  35.31 
 
 		 369 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  0.114753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1071  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.88 
 
 		 369 aa  169  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.001504  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4458  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.33 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3925  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.61 
 
 		 388 aa  159  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  32.94 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3553  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.84 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.185517 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4975  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.97 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0890752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  32.35 
 
 		 376 aa  133  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0951632  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0232  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.08 
 
 		 372 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0313  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.11 
 
 		 371 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0239  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.81 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1303  gluconate dehydratase / galactonate dehydratase  29.1 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.33 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3370  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.44 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.90513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.79 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2271  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.5 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.897407  normal  0.90491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1308  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.31 
 
 		 384 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3395  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.8 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.38 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  25.07 
 
 		 384 aa  120  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0244  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.11 
 
 		 383 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0781522  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.8 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.45 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3962  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.91 
 
 		 370 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.01 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.72 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.06 
 
 		 423 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.09 
 
 		 378 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36070  hypothetical protein  28.06 
 
 		 391 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000846029 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  28.88 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  29.02 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6459  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.68 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0253922  hitchhiker  0.000000313702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3074  hypothetical protein  26.55 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0475  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.45 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  30.42 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1685  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.53 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  30.42 
 
 		 382 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2580  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.7 
 
 		 369 aa  109  9.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  30.12 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2226  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.706193 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.99 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.49 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  30.12 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  30.12 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  30.12 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0547  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  33.6 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  28.08 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  30.12 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.87 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4167  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.53 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585922 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4045  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.36 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.29 
 
 		 403 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3195  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.16 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  29.85 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2447  putative mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.86 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  29.97 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1460  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.91 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1173  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.47 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0426063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  30.03 
 
 		 502 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0935  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.27 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.152576  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  29.17 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4225  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.95 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  28.87 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  29.23 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.15 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  28.87 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  28.87 
 
 		 382 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  28.87 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  28.87 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  30.82 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  28.87 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.48 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.601828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2405  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.49 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.44174  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.66 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  29.01 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  29.66 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01739  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.13 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3926  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.32 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0074  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.53 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  30.05 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4042  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.04 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.62 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.84 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3008  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.22 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334254  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7855  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.44 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2214  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.36 
 
 		 378 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>