More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1956 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1956  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  100 
 
 		 385 aa  793    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0267  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.22 
 
 		 384 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.806293  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3372  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.22 
 
 		 384 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3868  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.21 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4045  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.94 
 
 		 384 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1877  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.22 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0345  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.44 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3538  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.61 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1847  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.8 
 
 		 382 aa  361  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1091  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.66 
 
 		 387 aa  359  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.08586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2707  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  48.44 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.371679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3247  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  48.68 
 
 		 388 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.7 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5120  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  34.63 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  0.114753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1071  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  36.55 
 
 		 369 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.001504  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3925  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.53 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.84 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4458  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3553  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.06 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.185517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.34 
 
 		 378 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2271  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.2 
 
 		 369 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.897407  normal  0.90491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3370  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.56 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.90513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1173  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.66 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0426063  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3395  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.24 
 
 		 369 aa  123  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.97 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4167  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.05 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.53 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4045  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.37 
 
 		 396 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0821  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.81 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.48 
 
 		 373 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.1 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.14 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4225  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.78 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3926  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.03 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2476  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.15 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3962  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.41 
 
 		 370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2579  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.52 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.69 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4083  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.49 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.386649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3977  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.49 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.618282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3915  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.49 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4022  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.49 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0232  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.36 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3561  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.43 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4521  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.08 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0239  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.05 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.41 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.57 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0951632  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.57 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0918  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.26 
 
 		 398 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.6 
 
 		 384 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3336  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.29 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.21 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01739  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.65 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.49 
 
 		 411 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4454  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.32 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3673  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.35 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.232525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3386  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.95 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4975  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.16 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0890752 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  28.69 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0313  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.22 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4686  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.83 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455034  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  28.77 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.25 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  28.77 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36070  hypothetical protein  27.68 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000846029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  29.86 
 
 		 382 aa  107  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1686  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.63 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3074  hypothetical protein  27.38 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2836  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  25.92 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.182529  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.62 
 
 		 390 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1050  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.22 
 
 		 381 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0435  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.85 
 
 		 383 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00387295  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  28.49 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  28.21 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  28.25 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  28.81 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  28.21 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  28.21 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  28.49 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  28.49 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  28.49 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4042  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.66 
 
 		 379 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2214  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.13 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0038  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.26 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  28.21 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  28.21 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0244  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.79 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0781522  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  26.8 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3056  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.76 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1685  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.79 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0032  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.89 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5071  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.04 
 
 		 390 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  27.98 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  27.98 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3211  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.04 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4374  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.76 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0028  putative mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  27.71 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370595  normal  0.102793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.35 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>