More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3925 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3925  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 388 aa  800    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  69.87 
 
 		 391 aa  561  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4458  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  49.19 
 
 		 399 aa  347  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3553  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.49 
 
 		 385 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.185517 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5120  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  35.57 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  0.114753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1956  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  35.53 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1877  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.96 
 
 		 384 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1847  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.22 
 
 		 382 aa  172  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3868  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.48 
 
 		 384 aa  172  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4045  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.92 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1071  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.09 
 
 		 369 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.001504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3538  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.54 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0345  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.87 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0267  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.19 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.806293  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3372  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.19 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2707  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.96 
 
 		 384 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.371679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3247  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.48 
 
 		 388 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1091  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.61 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.08586 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.77 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.63 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.35 
 
 		 382 aa  133  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1460  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.45 
 
 		 403 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.97 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.55 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.8 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.42 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0917  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.18 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.8 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  28.72 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1303  gluconate dehydratase / galactonate dehydratase  29.23 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.92 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  29.43 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  28.42 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  27.49 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5534  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.23 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  29.43 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  28.46 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  28.46 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  27.93 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  29.43 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  28.96 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  28.42 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  29.16 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  29.16 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  28.42 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  28.42 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  29.16 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  29.16 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.96 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6746  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.75 
 
 		 368 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0994  putative mandelate racemase / muconatelactonizing enzyme  27.05 
 
 		 392 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0973014  normal  0.486209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.02 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0028  putative mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  29.03 
 
 		 362 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370595  normal  0.102793 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  29.81 
 
 		 502 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0821  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.56 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4521  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  25.81 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  28.14 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  26.7 
 
 		 382 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.81 
 
 		 372 aa  97.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0038  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.62 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1173  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.17 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0426063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.15 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  28.2 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.64 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  28.87 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2579  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  26.76 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0032  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.12 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  29.33 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1862  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.79 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.324326  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4537  galactonate dehydratase  26.33 
 
 		 385 aa  94  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4045  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.27 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.21 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  26.7 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2226  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.3 
 
 		 366 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.706193 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.37 
 
 		 401 aa  92.8  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.34 
 
 		 390 aa  92.8  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.16 
 
 		 373 aa  92.8  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3962  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.64 
 
 		 370 aa  92.8  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  29.49 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.73 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4167  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  24.73 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585922 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4225  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6459  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.81 
 
 		 377 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0253922  hitchhiker  0.000000313702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2244  galactonate dehydratase  28.85 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174504  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01739  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.73 
 
 		 394 aa  90.9  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.66 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1686  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  26.91 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3341  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.86 
 
 		 399 aa  89.7  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0845  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.63 
 
 		 392 aa  89.7  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0951  galactonate dehydratase  28.26 
 
 		 382 aa  89.4  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4981  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.67 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.49 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.19 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  28.1 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0313  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.26 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.85 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2499  mandelate racemase  25.2 
 
 		 400 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5866  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.3 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0167811  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>