More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0345 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0267  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  91.38 
 
 
384 aa  742    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.806293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2707  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  80.1 
 
 
384 aa  643    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.371679  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0345  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
384 aa  799    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4045  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  87.73 
 
 
384 aa  714    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3372  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  91.41 
 
 
384 aa  743    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3868  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  87.73 
 
 
384 aa  714    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3538  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  75.98 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1877  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  73.49 
 
 
384 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3247  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  72.89 
 
 
388 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1847  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.35 
 
 
382 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1091  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  56.2 
 
 
387 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.08586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1956  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  48.44 
 
 
385 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0179909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1071  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  35.55 
 
 
369 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.001504  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5120  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.59 
 
 
369 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  0.114753 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2826  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.61 
 
 
391 aa  189  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3925  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.87 
 
 
388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.77 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4458  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.99 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3553  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.85 
 
 
385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.185517 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  25.9 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  31.74 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  30.64 
 
 
382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.2 
 
 
378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  30.47 
 
 
382 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
373 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.61 
 
 
388 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2271  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.2 
 
 
369 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.897407  normal  0.90491 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  31.27 
 
 
382 aa  122  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  31.3 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  31.3 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  31.3 
 
 
382 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  31.3 
 
 
382 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  30.39 
 
 
382 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  29.92 
 
 
382 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  30.92 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  31.02 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  30.39 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  29.92 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  31.3 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.4 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  31.55 
 
 
382 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1308  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.75 
 
 
384 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.13 
 
 
376 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0951632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3962  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.35 
 
 
370 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0475  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.37 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1303  gluconate dehydratase / galactonate dehydratase  26.82 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.22 
 
 
390 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3370  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.37 
 
 
389 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.90513  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.57 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.98 
 
 
382 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  30.75 
 
 
382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6459  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.25 
 
 
377 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0253922  hitchhiker  0.000000313702 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  28.9 
 
 
382 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  28.9 
 
 
382 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4042  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.74 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0552  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  27.35 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4454  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.64 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1173  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.61 
 
 
391 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0426063  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.36 
 
 
382 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  30.36 
 
 
401 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  28.61 
 
 
382 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3263  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.24 
 
 
378 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  28.61 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.45 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0032  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.88 
 
 
375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  28.61 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2244  galactonate dehydratase  28.85 
 
 
382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174504  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  28.61 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  28.61 
 
 
382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0822  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.71 
 
 
370 aa  113  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3395  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.05 
 
 
369 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  28.53 
 
 
382 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  29.01 
 
 
502 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3665  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.94 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.16 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1050  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.84 
 
 
381 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.18 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.601828  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2277  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.2 
 
 
402 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.612864  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.87 
 
 
382 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.48 
 
 
403 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0038  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.49 
 
 
375 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.21 
 
 
369 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1686  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  24.81 
 
 
391 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.17 
 
 
373 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.21 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.21 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.21 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  25.13 
 
 
382 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.67 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.56 
 
 
369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.21 
 
 
369 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.71 
 
 
355 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  31.46 
 
 
382 aa  107  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01739  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.14 
 
 
394 aa  107  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2405  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.5 
 
 
374 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.44174  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  24.14 
 
 
386 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0994  putative mandelate racemase / muconatelactonizing enzyme  27.96 
 
 
392 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0973014  normal  0.486209 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.42 
 
 
423 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3936  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.98 
 
 
410 aa  106  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5408  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.26 
 
 
396 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>