216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1202 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1253  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 331 aa  656    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1202  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 331 aa  656    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0668  flagellar basal body P-ring protein  63.44 
 
 		 329 aa  423  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0225327  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0843  flagellar basal body P-ring protein  63.66 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0330  flagellar basal body P-ring protein  57.7 
 
 		 328 aa  404  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  41.36 
 
 		 368 aa  278  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  42.07 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  41.19 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  40.46 
 
 		 398 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  39.88 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  39.02 
 
 		 363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  39.19 
 
 		 364 aa  251  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  40.82 
 
 		 367 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  37.85 
 
 		 369 aa  250  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  40.5 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  38.92 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  40.8 
 
 		 378 aa  236  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2267  flagellar basal body P-ring protein  37.86 
 
 		 383 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  36.96 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  36.91 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  36.68 
 
 		 380 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  38.22 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  38.15 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  38.76 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  38.15 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  37.57 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  37.33 
 
 		 374 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  39.37 
 
 		 371 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  38.15 
 
 		 374 aa  228  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  37.93 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  38.89 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0394  flagellar P-ring protein  40 
 
 		 378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0514922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  37.64 
 
 		 373 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16540  flagellar P-ring protein  37.08 
 
 		 383 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000030523  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  38.4 
 
 		 370 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  38.03 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  37.17 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  37.75 
 
 		 371 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  37.1 
 
 		 376 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  39.65 
 
 		 371 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  37.64 
 
 		 369 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  37.64 
 
 		 369 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  38.78 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  37.75 
 
 		 371 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  37.06 
 
 		 366 aa  222  7e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  36.99 
 
 		 373 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  38.06 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  37.91 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  36.99 
 
 		 373 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  37.64 
 
 		 371 aa  220  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  36.1 
 
 		 378 aa  219  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  35.52 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  36.96 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  37.5 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  36.89 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  37.54 
 
 		 371 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  38.44 
 
 		 374 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  37.5 
 
 		 363 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  40.58 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  37.29 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  35.77 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  36.17 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  36.07 
 
 		 365 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  35.34 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  34.48 
 
 		 401 aa  215  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  35.15 
 
 		 367 aa  215  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0782  flagellar basal body P-ring protein  37.78 
 
 		 352 aa  215  8e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  34.79 
 
 		 369 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  34.79 
 
 		 369 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  35.26 
 
 		 376 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  37.06 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  36.81 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  37.43 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  37.43 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  37.43 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  37.43 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  36.1 
 
 		 370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  36.86 
 
 		 370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  37.7 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  36.36 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  36.26 
 
 		 366 aa  212  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  36.61 
 
 		 364 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  36.84 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  38.19 
 
 		 361 aa  212  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  35.5 
 
 		 369 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  36.78 
 
 		 362 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  35.5 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0400  flagellar basal body P-ring protein  36.68 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.574855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  37.28 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  34.52 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  36.22 
 
 		 392 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0096  flagellar basal body P-ring protein  38.3 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  39.67 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  36.29 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  37.07 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  37.01 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0562  flagellar basal body P-ring protein  37.05 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1653  flagellar P-ring protein  36.91 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  36.07 
 
 		 373 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  36.71 
 
 		 370 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>