215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0562 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0562  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
351 aa  703    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1143  flagellar P-ring protein  55.56 
 
 
350 aa  389  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0096  flagellar basal body P-ring protein  53.95 
 
 
349 aa  373  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0782  flagellar basal body P-ring protein  53.95 
 
 
352 aa  362  4e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1031  flagellar basal body P-ring protein  51.57 
 
 
350 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0715097  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1810  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 
348 aa  339  4e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1636  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 
348 aa  339  5e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1455  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 
348 aa  338  7e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0400  flagellar basal body P-ring protein  48.48 
 
 
348 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.574855  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  39.78 
 
 
363 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  41.8 
 
 
368 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  40 
 
 
364 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  41.26 
 
 
365 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  39.89 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  40.4 
 
 
361 aa  252  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  40.86 
 
 
386 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  39.42 
 
 
398 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2926  flagellar basal body P-ring protein  41.76 
 
 
351 aa  249  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625309  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  39.18 
 
 
370 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  39.44 
 
 
376 aa  249  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  40.06 
 
 
370 aa  248  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  38.87 
 
 
363 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  39.25 
 
 
372 aa  247  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  39.78 
 
 
370 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  38.84 
 
 
398 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  38.08 
 
 
401 aa  246  6e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  39.32 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  39.3 
 
 
367 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  36.67 
 
 
369 aa  243  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  38.48 
 
 
369 aa  242  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  36.81 
 
 
364 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  38.9 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  39.67 
 
 
386 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  39.6 
 
 
378 aa  238  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  37.4 
 
 
377 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0270  flagellar basal body P-ring protein  39.83 
 
 
371 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.830393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  38.23 
 
 
377 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  37.98 
 
 
370 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  37.57 
 
 
374 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3364  flagellar basal body P-ring protein  40 
 
 
366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  38.4 
 
 
377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  38.37 
 
 
373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16540  flagellar P-ring protein  37.57 
 
 
383 aa  235  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000030523  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  37.79 
 
 
371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  36.73 
 
 
378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  39.57 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1653  flagellar P-ring protein  39.78 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  38.48 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  39.83 
 
 
413 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  38.4 
 
 
392 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  37.5 
 
 
366 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  38.44 
 
 
371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  38.4 
 
 
370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  37.79 
 
 
374 aa  233  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  36.34 
 
 
370 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  36.51 
 
 
365 aa  232  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  39.53 
 
 
357 aa  232  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  38.29 
 
 
381 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  37.5 
 
 
363 aa  232  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  39.02 
 
 
369 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  39.02 
 
 
369 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3108  flagellar basal body P-ring protein  39.08 
 
 
374 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.043594  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3835  flagellar basal body P-ring protein  39.08 
 
 
374 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  37.26 
 
 
365 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  39.54 
 
 
362 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  37.12 
 
 
391 aa  230  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  36.81 
 
 
367 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  37.79 
 
 
373 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  37.79 
 
 
373 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  39.39 
 
 
371 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  38.44 
 
 
380 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  35.85 
 
 
371 aa  230  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  38.44 
 
 
380 aa  230  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4678  flagellar P-ring protein  37.36 
 
 
374 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  37.47 
 
 
390 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  35.78 
 
 
377 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  34.08 
 
 
371 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  37.87 
 
 
383 aa  229  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  37.74 
 
 
391 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  37.74 
 
 
391 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  37.74 
 
 
391 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  35.84 
 
 
372 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  36.99 
 
 
370 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  39 
 
 
374 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  36.63 
 
 
378 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  36.81 
 
 
380 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  38.19 
 
 
367 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  36.89 
 
 
363 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2963  flagellar basal body P-ring protein  38.69 
 
 
366 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.863915  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1532  flagellar basal body P-ring protein  38.4 
 
 
369 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.760833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  36.41 
 
 
364 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  35.48 
 
 
375 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  35.96 
 
 
371 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2048  flagellar basal body P-ring protein  39.84 
 
 
365 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.159552  normal  0.112526 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  33.62 
 
 
371 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2520  flagellar basal body P-ring protein  39.84 
 
 
365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1203  flagellar basal body P-ring protein  39.84 
 
 
365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0939901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  37.46 
 
 
376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  36.94 
 
 
372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1459  flagellar basal body P-ring protein  39.84 
 
 
365 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.31008  hitchhiker  0.000149159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>