216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1653 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1653  flagellar P-ring protein  100 
 
 
363 aa  725    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  44.03 
 
 
368 aa  281  9e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  43.71 
 
 
367 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  42.93 
 
 
364 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  43.09 
 
 
368 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  42.78 
 
 
365 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  40.54 
 
 
369 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  43.27 
 
 
371 aa  270  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  41.53 
 
 
370 aa  269  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  42.13 
 
 
380 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  42.13 
 
 
380 aa  267  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  43.9 
 
 
384 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  41.78 
 
 
374 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  40.49 
 
 
377 aa  263  3e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  41.42 
 
 
363 aa  263  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  42.53 
 
 
373 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  42.93 
 
 
392 aa  263  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  43.27 
 
 
371 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  43.55 
 
 
377 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  41.21 
 
 
365 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  43.37 
 
 
374 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  42.69 
 
 
378 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  41.76 
 
 
377 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  42.53 
 
 
370 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  40.11 
 
 
371 aa  260  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  41.33 
 
 
398 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  40.75 
 
 
398 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  41.76 
 
 
375 aa  258  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  43.42 
 
 
386 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  43.55 
 
 
376 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  41.48 
 
 
373 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  41.26 
 
 
378 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  39.18 
 
 
367 aa  255  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  41.31 
 
 
373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0270  flagellar basal body P-ring protein  41.3 
 
 
371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.830393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  42.36 
 
 
378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  42.49 
 
 
378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  41.48 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  43.22 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  41.88 
 
 
373 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  40.16 
 
 
363 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  42.67 
 
 
381 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  40.16 
 
 
363 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  41.88 
 
 
374 aa  252  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3364  flagellar basal body P-ring protein  41.03 
 
 
366 aa  252  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  41.88 
 
 
373 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  41.04 
 
 
401 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  41.29 
 
 
370 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  42.16 
 
 
366 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  41.48 
 
 
370 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  41.88 
 
 
413 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  41.51 
 
 
383 aa  249  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  39.11 
 
 
391 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0096  flagellar basal body P-ring protein  40.05 
 
 
349 aa  248  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0562  flagellar basal body P-ring protein  41.36 
 
 
385 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  39.04 
 
 
390 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  40.34 
 
 
394 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  41.6 
 
 
357 aa  247  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  43.48 
 
 
372 aa  247  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  41.79 
 
 
367 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0191  flagellar basal body P-ring protein  39.78 
 
 
387 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.774706  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  40.34 
 
 
391 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  40.34 
 
 
392 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  40.34 
 
 
391 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2236  flagellar P-ring protein  41.81 
 
 
369 aa  246  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  39.4 
 
 
369 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  41.33 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  38.69 
 
 
364 aa  246  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16540  flagellar P-ring protein  42.9 
 
 
383 aa  245  6.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000030523  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  39.3 
 
 
378 aa  245  6.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  40.22 
 
 
369 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  39.25 
 
 
392 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  40.22 
 
 
369 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  40.49 
 
 
367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  39.39 
 
 
397 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  42.45 
 
 
374 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  39.39 
 
 
401 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  40.49 
 
 
365 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  39.11 
 
 
401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3108  flagellar basal body P-ring protein  42.12 
 
 
374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.043594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  41 
 
 
371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  42.98 
 
 
374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3835  flagellar basal body P-ring protein  42.12 
 
 
374 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0244  flagellar basal body P-ring protein  39.5 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  39.11 
 
 
397 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  39.11 
 
 
401 aa  242  9e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  38.77 
 
 
371 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  39.11 
 
 
400 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  39.11 
 
 
400 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  39.11 
 
 
394 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  39.95 
 
 
371 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  42.05 
 
 
384 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  40.11 
 
 
370 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4428  flagellar basal body P-ring protein  42.74 
 
 
388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  39.83 
 
 
367 aa  239  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2963  flagellar basal body P-ring protein  40.81 
 
 
366 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.863915  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  39.29 
 
 
363 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  40.56 
 
 
362 aa  239  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  41.6 
 
 
370 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  36.64 
 
 
376 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>