216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0394 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0394  flagellar P-ring protein  100 
 
 		 378 aa  752    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0514922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  48.99 
 
 		 368 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  48.12 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  46.59 
 
 		 364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  47.4 
 
 		 367 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  44.78 
 
 		 363 aa  295  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  44.38 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  45.98 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  46.03 
 
 		 363 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  44.06 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  45.84 
 
 		 371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  44.64 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  45.74 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  47.15 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  44.17 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  46.15 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  46.67 
 
 		 378 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  45.6 
 
 		 365 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  43.73 
 
 		 374 aa  272  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  42.42 
 
 		 378 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  45.03 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  44.75 
 
 		 380 aa  269  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  44.67 
 
 		 371 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  44.18 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  42.44 
 
 		 373 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  44.38 
 
 		 377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  44.08 
 
 		 364 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  45.43 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  41.62 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  42.15 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  43.79 
 
 		 371 aa  263  4.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  43.43 
 
 		 372 aa  262  6.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  41.26 
 
 		 373 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  41.03 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  43.23 
 
 		 374 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  42.13 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  43.48 
 
 		 370 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2236  flagellar P-ring protein  44.99 
 
 		 369 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  44.79 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  43.83 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  46.8 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  45.64 
 
 		 376 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16540  flagellar P-ring protein  43.06 
 
 		 383 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000030523  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  42.7 
 
 		 363 aa  256  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  42.7 
 
 		 363 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  42.74 
 
 		 363 aa  255  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  41.6 
 
 		 376 aa  255  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  42.7 
 
 		 363 aa  255  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  42.98 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  42.13 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  42.98 
 
 		 371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  40.33 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  41.36 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  43.5 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  42.15 
 
 		 363 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  40.05 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  40.05 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  39.9 
 
 		 386 aa  252  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  41.87 
 
 		 363 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  41.87 
 
 		 363 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  41.87 
 
 		 363 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  41.87 
 
 		 363 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  42.42 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  40.38 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  40.97 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  42.62 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  42.05 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  39.68 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1653  flagellar P-ring protein  40.61 
 
 		 363 aa  249  4e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  42.31 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  41.24 
 
 		 369 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  42.12 
 
 		 369 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  43.66 
 
 		 366 aa  249  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  42.12 
 
 		 369 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  43.27 
 
 		 363 aa  249  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  39.79 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  40.17 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  42.78 
 
 		 412 aa  247  3e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  42.05 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  42.05 
 
 		 375 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  42.98 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  42.9 
 
 		 357 aa  246  6e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  43.68 
 
 		 366 aa  246  6.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  40.11 
 
 		 377 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  41.03 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  41.76 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  40.53 
 
 		 391 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  40.53 
 
 		 391 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  42.9 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  39.84 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  40.46 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  40.53 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  41.03 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  45.93 
 
 		 371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  43.46 
 
 		 374 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  42.17 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  43.37 
 
 		 367 aa  243  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  43.48 
 
 		 372 aa  242  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  43.48 
 
 		 372 aa  242  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>