215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2236 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2236  flagellar P-ring protein  100 
 
 		 369 aa  712    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  44.74 
 
 		 369 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  43.4 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  44.83 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  43.87 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  44.24 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  45.98 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  45.26 
 
 		 365 aa  263  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  45.69 
 
 		 368 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  44.27 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  42.93 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0394  flagellar P-ring protein  44.35 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0514922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  43.39 
 
 		 398 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  42.7 
 
 		 371 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  43.1 
 
 		 398 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1653  flagellar P-ring protein  40 
 
 		 363 aa  247  3e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  42.82 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  41.6 
 
 		 369 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  42.9 
 
 		 392 aa  246  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  42.55 
 
 		 373 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  45.43 
 
 		 370 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  41.67 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  44.03 
 
 		 371 aa  242  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  41.07 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  42.57 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  45.38 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  42.57 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  41.07 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16540  flagellar P-ring protein  41.95 
 
 		 383 aa  240  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000030523  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  40.8 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  40.05 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  41.29 
 
 		 376 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  45.09 
 
 		 371 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  40.91 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  40.86 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  39.52 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  44.13 
 
 		 371 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  40.92 
 
 		 386 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  43.58 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  40.86 
 
 		 362 aa  235  8e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  43.66 
 
 		 370 aa  235  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  42.71 
 
 		 369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  41.35 
 
 		 374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  38.67 
 
 		 370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  41.94 
 
 		 386 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  40.64 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  42.7 
 
 		 357 aa  232  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  43.82 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  40.74 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  42.05 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  39.2 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  42.25 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  42.9 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  41.71 
 
 		 367 aa  229  6e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  44.07 
 
 		 367 aa  229  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  40.57 
 
 		 369 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  39.94 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  40.21 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  42.25 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  39.55 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2926  flagellar basal body P-ring protein  42.03 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  38.79 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  38.79 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  41.02 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  39.84 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  39.66 
 
 		 394 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  42.42 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  42.47 
 
 		 383 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  41.55 
 
 		 371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  40.22 
 
 		 392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  39.37 
 
 		 365 aa  226  7e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  39.04 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  39.41 
 
 		 366 aa  225  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  40.8 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  41.09 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  40.23 
 
 		 374 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  40.23 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  39.39 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2914  flagellar basal body P-ring protein  37.97 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  40 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  42.17 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  38.36 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  40.37 
 
 		 363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  38.93 
 
 		 364 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  40.79 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  39 
 
 		 401 aa  222  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  38.72 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  41.09 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  40.52 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  38.72 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  38.72 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  38.72 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  38.72 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  40.33 
 
 		 379 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  41.14 
 
 		 363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  40.59 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  39.94 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  41.31 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0562  flagellar basal body P-ring protein  40.86 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  38.72 
 
 		 401 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>