216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0843 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0843  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 
333 aa  652    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0668  flagellar basal body P-ring protein  65.77 
 
 
329 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0225327  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1253  flagellar basal body P-ring protein  63.66 
 
 
331 aa  432  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1202  flagellar basal body P-ring protein  63.66 
 
 
331 aa  432  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0330  flagellar basal body P-ring protein  57.96 
 
 
328 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  40.67 
 
 
369 aa  261  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  41.48 
 
 
368 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  42.69 
 
 
367 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  41.39 
 
 
365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  41.38 
 
 
365 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  40.43 
 
 
368 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  39.51 
 
 
364 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  40.17 
 
 
398 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  40.29 
 
 
398 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  40.33 
 
 
363 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  40.33 
 
 
386 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0394  flagellar P-ring protein  41.35 
 
 
378 aa  239  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0514922  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1653  flagellar P-ring protein  40.43 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  37.85 
 
 
370 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  42.52 
 
 
363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  38.89 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0096  flagellar basal body P-ring protein  41.01 
 
 
349 aa  233  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  40.17 
 
 
369 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  40.17 
 
 
369 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  39.42 
 
 
373 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  41.52 
 
 
372 aa  229  6e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  39.78 
 
 
367 aa  228  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  40.41 
 
 
369 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  39.5 
 
 
369 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  40.41 
 
 
369 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0782  flagellar basal body P-ring protein  38.81 
 
 
352 aa  227  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  39.78 
 
 
371 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  38.55 
 
 
401 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  40.41 
 
 
362 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  39.13 
 
 
374 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  38.84 
 
 
378 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16540  flagellar P-ring protein  35.34 
 
 
383 aa  225  8e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000030523  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2267  flagellar basal body P-ring protein  38.26 
 
 
383 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  38.84 
 
 
374 aa  225  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1031  flagellar basal body P-ring protein  39.6 
 
 
350 aa  224  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0715097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  38.04 
 
 
370 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  38.19 
 
 
372 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  38.32 
 
 
380 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  38.73 
 
 
378 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  40 
 
 
383 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  38.55 
 
 
373 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  38.75 
 
 
368 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  38.19 
 
 
371 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  36.93 
 
 
371 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1810  flagellar basal body P-ring protein  40.51 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  40.11 
 
 
363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  36.65 
 
 
371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  39.34 
 
 
363 aa  222  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  38.19 
 
 
369 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  39.45 
 
 
363 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1636  flagellar basal body P-ring protein  40.51 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0562  flagellar basal body P-ring protein  37.57 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  35.5 
 
 
380 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  39.45 
 
 
363 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  39.07 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  35.5 
 
 
380 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  38.5 
 
 
369 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  36.65 
 
 
371 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  38.81 
 
 
371 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  38.26 
 
 
373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  37.33 
 
 
371 aa  220  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  37.4 
 
 
386 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1455  flagellar basal body P-ring protein  40.23 
 
 
348 aa  219  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  40.41 
 
 
363 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  40.41 
 
 
363 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  40.41 
 
 
363 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  40.41 
 
 
363 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  39.48 
 
 
366 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  40.41 
 
 
363 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  38.25 
 
 
365 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  40.41 
 
 
363 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  40.58 
 
 
363 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  37.84 
 
 
370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0400  flagellar basal body P-ring protein  38.61 
 
 
348 aa  216  5e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.574855  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  35.22 
 
 
378 aa  216  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  36.71 
 
 
371 aa  215  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  38.15 
 
 
377 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  39.56 
 
 
363 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  39.18 
 
 
374 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  37.74 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  36.13 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  37.47 
 
 
366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  35.95 
 
 
369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  39.18 
 
 
378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  36.53 
 
 
392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  35.5 
 
 
376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  35.99 
 
 
376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  38.84 
 
 
374 aa  212  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  37.57 
 
 
377 aa  212  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  36.41 
 
 
362 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  36.58 
 
 
377 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  36.31 
 
 
381 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  36.8 
 
 
397 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  36.8 
 
 
400 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  36.8 
 
 
401 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>