216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0668 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0668  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 329 aa  649    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0225327  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0843  flagellar basal body P-ring protein  65.77 
 
 		 333 aa  445  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1253  flagellar basal body P-ring protein  63.44 
 
 		 331 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1202  flagellar basal body P-ring protein  63.44 
 
 		 331 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0330  flagellar basal body P-ring protein  59.34 
 
 		 328 aa  394  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  43.1 
 
 		 368 aa  278  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  41.42 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  41.38 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  40 
 
 		 364 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  38.48 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  41.33 
 
 		 398 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  40.75 
 
 		 398 aa  252  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  40 
 
 		 363 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  39.94 
 
 		 383 aa  242  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1144  flagellar P-ring protein  40.06 
 
 		 365 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000168171  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  37.4 
 
 		 380 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  37.4 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1653  flagellar P-ring protein  39.07 
 
 		 363 aa  236  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  39.71 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  37.71 
 
 		 377 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  38.73 
 
 		 378 aa  235  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  38.08 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0782  flagellar basal body P-ring protein  39.94 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2267  flagellar basal body P-ring protein  38.7 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  37.86 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  39.26 
 
 		 373 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  39.08 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  38.73 
 
 		 376 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  38.16 
 
 		 378 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16540  flagellar P-ring protein  38.11 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000030523  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0394  flagellar P-ring protein  39.36 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0514922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  37.64 
 
 		 374 aa  229  7e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  37.78 
 
 		 374 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  36.21 
 
 		 370 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1031  flagellar basal body P-ring protein  38.92 
 
 		 350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0715097  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  36.62 
 
 		 370 aa  225  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  38.62 
 
 		 378 aa  225  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  36.26 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  36.55 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  38.08 
 
 		 371 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  38.71 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  38.33 
 
 		 371 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  37.88 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0400  flagellar basal body P-ring protein  37.57 
 
 		 348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.574855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  36.99 
 
 		 370 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  38.48 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  37.85 
 
 		 369 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  36.99 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  37.09 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  37.64 
 
 		 374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  34.5 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  37.13 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  37.13 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  37.94 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  36.84 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  35.93 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  36.74 
 
 		 369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  37.4 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  37.43 
 
 		 374 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0096  flagellar basal body P-ring protein  37.29 
 
 		 349 aa  212  9e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  37.02 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  35.44 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  36.96 
 
 		 371 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  35.23 
 
 		 371 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  36.29 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2926  flagellar basal body P-ring protein  35.47 
 
 		 351 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  36.74 
 
 		 363 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  36.74 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  38.71 
 
 		 368 aa  209  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1636  flagellar basal body P-ring protein  36.24 
 
 		 348 aa  209  5e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1810  flagellar basal body P-ring protein  36.24 
 
 		 348 aa  209  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  36 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  34.94 
 
 		 371 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  38.22 
 
 		 362 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  37.93 
 
 		 369 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  37.93 
 
 		 369 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  36.57 
 
 		 365 aa  208  8e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  37.28 
 
 		 373 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  36 
 
 		 375 aa  209  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  36.84 
 
 		 364 aa  209  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  36.19 
 
 		 363 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  36.19 
 
 		 363 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  36.19 
 
 		 363 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  36.19 
 
 		 363 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  38.12 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  32.97 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  32.97 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  35.5 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1455  flagellar basal body P-ring protein  35.96 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  36.81 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  36.01 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  39.26 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  36.57 
 
 		 363 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  36.84 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  37.5 
 
 		 364 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  35.16 
 
 		 367 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  36.57 
 
 		 413 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  35.26 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  37.36 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  34.72 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>