93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2447 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2447  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 325 aa  666    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.43322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  77.04 
 
 		 324 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  73.82 
 
 		 337 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.31 
 
 		 329 aa  482  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  73.19 
 
 		 334 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  68.47 
 
 		 326 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  68.47 
 
 		 326 aa  457  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  66.88 
 
 		 326 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  68.47 
 
 		 326 aa  458  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  67.19 
 
 		 333 aa  457  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  67.19 
 
 		 333 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.52 
 
 		 325 aa  444  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  59.62 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1097  hypothetical cytosolic protein  70.29 
 
 		 279 aa  388  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  59.62 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  58.99 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  55.69 
 
 		 322 aa  378  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  58.52 
 
 		 322 aa  375  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  58.52 
 
 		 322 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  43.37 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  25.91 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  28.15 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  27.34 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.38 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  23.03 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.22 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.33 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  24.2 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.27 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  24.92 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.8 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.37 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  25.33 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  25.48 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.68 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.54 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  23.9 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.4 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.09 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.26 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.75 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  24.73 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  23.61 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.78 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  22.8 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.14 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  24.53 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  23.51 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  23.46 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.87 
 
 		 309 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  22.64 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  26.71 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.74 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  24.06 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  21.94 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  22.33 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  23.22 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  22.33 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  22.43 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.22 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.86 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.32 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  21.32 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  23.34 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.91 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.91 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.91 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.2 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  24.05 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  21 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.17 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.05 
 
 		 327 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  21.27 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  24.92 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  25.31 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  21.72 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  23.58 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.54 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  19.74 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  23.47 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  23.96 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.08 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  26.32 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  24.73 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  21.29 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  18.92 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  17.57 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  22.43 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  22.13 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.4 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  22.32 
 
 		 319 aa  42.7  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  18.44 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>