94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2636 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 316 aa  645    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  57.24 
 
 		 337 aa  362  6e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  57.57 
 
 		 320 aa  360  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  55.05 
 
 		 315 aa  347  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  50.32 
 
 		 324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  48.31 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  45.3 
 
 		 303 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  42.57 
 
 		 313 aa  259  4e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  44.95 
 
 		 342 aa  242  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  40.26 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  40.6 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  42.6 
 
 		 327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  42.95 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.3 
 
 		 330 aa  237  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  43 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.36 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  42.96 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  41.64 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.14 
 
 		 304 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.72 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.94 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.42 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  42.01 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.21 
 
 		 306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.74 
 
 		 307 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  39.4 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  39.74 
 
 		 306 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  40.82 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  40.72 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.26 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.07 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.54 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.85 
 
 		 309 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  39.4 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  37.87 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.21 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.99 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.8 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  41.76 
 
 		 307 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.79 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  47.51 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  39.63 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  39.7 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  37.67 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.91 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  38 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.03 
 
 		 305 aa  202  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.45 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  39.33 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  38.66 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  41.92 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  38.04 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  37.59 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.54 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  42.76 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  39.41 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.02 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.02 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.98 
 
 		 277 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  39.74 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.11 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.49 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  37.7 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  37.3 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  37.7 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.53 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.6 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  42 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  37.72 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  28.78 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  26.92 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  25.37 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  26.71 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  26.12 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.89 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.8 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.8 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  24.74 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  24.74 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.61 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.1 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  25.87 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.72 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  25.72 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  25.4 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  39.29 
 
 		 130 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.18 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.7 
 
 		 334 aa  53.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2447  CRISPR-associated protein Cas1  28.33 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.43322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1097  hypothetical cytosolic protein  25.5 
 
 		 279 aa  50.4  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  25 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  21.81 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  26.92 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1321  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.4 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00529939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>