92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1587 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 332 aa  685    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  58.64 
 
 		 328 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  54.37 
 
 		 320 aa  355  5e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  53.56 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  37.54 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.46 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  37.97 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  36.54 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  37.66 
 
 		 320 aa  199  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  37.34 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.42 
 
 		 316 aa  195  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  36.19 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  34.81 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.11 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  33.23 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  35.74 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  36.65 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  38.26 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.02 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  41.02 
 
 		 303 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  37.76 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  37.55 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.19 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.98 
 
 		 307 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.84 
 
 		 306 aa  169  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.22 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.25 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.45 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  33.45 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  36.92 
 
 		 306 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  38.31 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  38.31 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.57 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.11 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  32.85 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.82 
 
 		 306 aa  159  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.85 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.58 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.57 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.57 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.14 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  33.22 
 
 		 305 aa  156  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  34.98 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.55 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.54 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  36.29 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.69 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.49 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.49 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  34.98 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  37.36 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  33.96 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  34.33 
 
 		 303 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  37.28 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  34.15 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  34.12 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.62 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  32.52 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  31.23 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  31.71 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  32.66 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  35.42 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  35 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.81 
 
 		 277 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  32.92 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 		 293 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  30.34 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  25.82 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  25.82 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  24.5 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  27.21 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.76 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.95 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.74 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  25.18 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  24.46 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.74 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  23.74 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  25.18 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  23.74 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  25.89 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.03 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.1 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.64 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.91 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1097  hypothetical cytosolic protein  24.29 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  24.15 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2447  CRISPR-associated protein Cas1  23.91 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.43322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  24.79 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.86 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>