89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4348 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 		 277 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  41.38 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.23 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  40.23 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.23 
 
 		 305 aa  205  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  41 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  40.23 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.77 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  40.61 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  39.85 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.64 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.23 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.69 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  39.08 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  40.61 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  40.61 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  39.85 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.02 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.23 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  38.17 
 
 		 307 aa  199  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.85 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.04 
 
 		 309 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.02 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.88 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.49 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.65 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.04 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.56 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  37.16 
 
 		 303 aa  191  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  37.28 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  40.38 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.04 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.84 
 
 		 255 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.69 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.98 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  40.22 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  35.18 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  31.54 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.87 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.87 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  32.31 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  29.89 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  32.18 
 
 		 313 aa  168  9e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  32.43 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  32.56 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  30.38 
 
 		 337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  31.3 
 
 		 315 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  32.82 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  30.32 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.42 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.65 
 
 		 330 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  32.93 
 
 		 327 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  32 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  31.67 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  28.79 
 
 		 291 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  28.79 
 
 		 291 aa  128  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  31.5 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  31.54 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  29.73 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.15 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  31.11 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.08 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  29.58 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  30.04 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.18 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  29.21 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.2 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.81 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  29.39 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  24.92 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  24.92 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  41.03 
 
 		 130 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.43 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  22.15 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.93 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.93 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.44 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  27.93 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  21.94 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  21.85 
 
 		 330 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  22.92 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.73 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  21.99 
 
 		 333 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  24.44 
 
 		 326 aa  42.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.22 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.44 
 
 		 326 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  23.76 
 
 		 325 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  24.44 
 
 		 326 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  31.76 
 
 		 326 aa  42  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>