103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0928 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  69.15 
 
 		 304 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  68.14 
 
 		 306 aa  421  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  64.53 
 
 		 306 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  64.86 
 
 		 306 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.85 
 
 		 306 aa  411  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  64.53 
 
 		 306 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.85 
 
 		 306 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  63.51 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  62.16 
 
 		 305 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  62.5 
 
 		 305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.51 
 
 		 307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  64.07 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  61.95 
 
 		 307 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  62.5 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.97 
 
 		 309 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  64.19 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.39 
 
 		 303 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  64.26 
 
 		 307 aa  397  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  64.38 
 
 		 307 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  61.62 
 
 		 306 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.92 
 
 		 307 aa  394  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  60.81 
 
 		 305 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  60.81 
 
 		 305 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  64.86 
 
 		 303 aa  393  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  60.47 
 
 		 305 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.64 
 
 		 306 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  63.51 
 
 		 307 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.37 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.37 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  59.47 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  62.32 
 
 		 299 aa  364  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  61.28 
 
 		 314 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.67 
 
 		 255 aa  344  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  60.53 
 
 		 319 aa  342  4e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  48.06 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  41.83 
 
 		 303 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.11 
 
 		 315 aa  221  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  39.46 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  39.47 
 
 		 303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  41.18 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  39.62 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  40.52 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.92 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  38.98 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.85 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  41.79 
 
 		 327 aa  195  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.33 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  39.03 
 
 		 318 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.16 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  36.12 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  39.93 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  40.46 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  38.54 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  36.56 
 
 		 291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  36.2 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  36.23 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.87 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  39.34 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  34.29 
 
 		 291 aa  176  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.77 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.13 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  35.82 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  38.3 
 
 		 294 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  38.52 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  35.19 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.46 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.86 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  36.26 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  62.07 
 
 		 130 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  24.48 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  23.62 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  26.52 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.52 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  26.52 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  24.28 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  23.96 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.98 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  24.44 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.98 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.53 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.77 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.24 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  21.97 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  21.97 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  29.74 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  27.27 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.04 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  27.27 
 
 		 325 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  27.27 
 
 		 325 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.44 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.89 
 
 		 331 aa  50.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  23.42 
 
 		 324 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.142175 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  37.1 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2447  CRISPR-associated protein Cas1  23.51 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.43322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.99 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  24.6 
 
 		 545 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  28.81 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1097  hypothetical cytosolic protein  23.36 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.73 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>